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Coronavirus : notre carte de France interactive du Covid-19 pour suivre la remontée du virus

La progression est particulièrement forte en Île-de-France et en Provence-Alpes-Côte d'Azur. CORONAVIRUS - C’est désormais une remontée exponentielle. Les chiffres hebdomadaires communiqués jeudi 13 août au soir par la Direction générale de la santé (DGS) sur la situation du Covid-19 en France ne laissent aucune place au doute: avec +41% pour le taux d’incidence et +42% pour le taux de positivité des tests en une semaine, la France est confrontée à une reprise de l’épidémie de coronavirus.

Coronavirus : notre carte de France interactive du Covid-19 pour suivre la remontée du virus

Par : Matthieu Balu

La progression est particulièrement forte en Île-de-France et en Provence-Alpes-Côte d’Azur.

CORONAVIRUS – C’est désormais une remontée exponentielle. Les chiffres hebdomadaires communiqués jeudi 13 août au soir par la Direction générale de la santé (DGS) sur la situation du Covid-19 en France ne laissent aucune place au doute: avec +41% pour le taux d’incidence et +42% pour le taux de positivité des tests en une semaine, la France est confrontée à une reprise de l’épidémie de coronavirus.

Ce sont désormais 33 départements ayant plus de 10 malades pour 100.000 habitants : la région Provence-Alpe-Côtes d’Azur est particulièrement sous surveillance. La seule bonne nouvelle provient de la Mayenne, le foyer épidémique de ces dernière semaines, qui a vu son taux d’incidence passer de 146 à 83, en “très nette diminution” indiquent les autorités.

Le nombre d’hospitalisations de malades atteints du Covid est lui aussi en hausse, pour la troisième semaine consécutive : 782 nouvelles entrées contre 604 la semaine précédente.

Paris et les Bouches-du-Rhône en “seuil d’alerte”

Pour y voir un peu plus clair sur la situation, Le HuffPost a mis au point une carte de France de la circulation du coronavirus, mise à jour automatiquement. Celle-ci montre bien cette nouvelle situation. Lors de notre première publication, le 23 juillet, seulement quatre départements avaient dépassé un seuil de vigilance en France métropolitaine (en vert clair). Il y en aujourd’hui plus d’une trentaine.

Paris et les Bouches-du-Rhône sont eux désormais en “seuil d’alerte” (en jaune sur notre carte) et sont passés ce vendredi en zone de circulation active du virus, selon un décret paru ce vendredi 14 août au Journal officiel. Les préfets des deux départements pourront dès lors prendre des mesures plus restrictives. En fonction de la situation, ceux-ci pourront par exemple “décider de la fermeture des restaurants, des marchés ou de limiter encore plus les rassemblements.

Nous avons choisi, dans un premier temps, de nous baser sur deux éléments principaux : le taux d’incidence (combien de cas pour 100.000 habitants) et le taux de positivité des tests. Chaque département est coloré en fonction de l’évolution de ces indicateurs. La première carte (bouton indice global) donne une vision générale de l’état de la situation. La seconde (bouton tendances) permet de voir l’évolution des indicateurs dans le temps.

Suivi de deux indicateurs de surveillance du Covid-19 par département

 Taux de positivité et taux d’incidence mis à jour en temps réel (moyenne sur les 7 derniers jours)

Indice global

Aucun seuil franchi Un seuil de vigilance franchi Un seuil d’alerte franchi Deux seuils de vigilance franchis  Un seuil d’alerte et un seuil de vigilance franchis  Deux seuils d’alerte franchis

Tendances

Baisse des deux indicateurs Incertitude Hausse des deux indicateurs

Indice global

Tendances

Pour des raisons techniques, les territoires ultramarins ne sont pas visibles, mais sont accessibles dans le moteur de recherche en haut à gauche (retrouvez ci-dessous nos explications et notre méthodologie)Cette carte se met à jour automatiquement dès que Santé publique France actualise les données mises en ligne sur data.gouv.fr (de manière quasi quotidienne).

Comment cette carte est-elle réalisée ?

Pour suivre l’évolution de l’épidémie, le gouvernement et les autorités de santé se basent sur de très nombreux indicateurs, plus ou moins fiables. D’autres devraient se rajouter à cet arsenal sous peu, comme l’analyse des eaux usées.

Quatre indicateurs sont particulièrement suivis et disposent de seuils de “vigilance” et d’“alerte”. Quand un seuil est franchi, “une analyse de risque approfondie est lancée” dans la zone géographique concernée, précise le ministère de la Santé. Voici ces 4 indicateurs:

  • Taux d’incidence, soit le nombre de tests PCR positifs pour 100.000 habitants par semaine. Le seuil de vigilance est à 10, le seuil d’alerte à 50.
  • Taux de positivité des tests, le seuil de vigilance est à 5%, le seuil d’alerte à 10%.
  • La part des lits de réanimationoccupés dans les hôpitaux, le seuil de vigilance est à 40%, le seuil d’alerte à 60%
  • Le R effectif, le taux de reproduction du virus. S’il est inférieur à 1, l’épidémie diminue, sinon, elle augmente plus ou moins vite. Le seuil de vigilance est à 1, le seuil d’alerte à 1,5.

 Pour réaliser la carte ci-dessus, nous avons choisi de nous baser principalement sur le taux d’incidence et de positivité (lissés sur la moyenne des 7 derniers jours). Dans un contexte de risque de reprise épidémie, la part des lits de réanimation ne semble pas la plus adaptée. Théoriquement, les autres indicateurs doivent en effet monter bien avant.

Quant au R effectif, s’il peut être très utile, sa méthode de calcul n’est toujours pas publique. De plus, les données mises à disposition par le gouvernement et Santé publique France ne sont pas très claires. Les mises à jour sont partiales, non régulières et sont limitées aux régions (pas de différenciation par département). Nous avons indiqué le R effectif dans les informations détaillées de chaque département, mais avons décidé de ne pas colorer la carte en fonction de cet indice tant que ses mises à jour ne seront pas calibrées sur le même format que celle des deux autres indicateurs.

Deux indicateurs complémentaires

Les taux d’incidence et de positivités sont intéressants à lire ensemble. Le premier permet de savoir si, dans une zone avec une population donnée, il y a beaucoup de cas de coronavirus. Mais seul, il peut être trompeur. Car on sait que le virus circule à bas bruit. Et que parfois, quand les conditions sont réunies, des clusters importants peuvent apparaître.

C’est pour cela que ce taux d’incidence, cette présence du coronavirus, doit être comparé avec d’autres indicateurs. Le taux de positivité, notamment, est utile pour cela. S’il y a beaucoup de cas dans un territoire (taux d’incidence), mais que cela est uniquement dû à un dépistage très développé, le taux de positivité sera faible. À l’inverse, s’il augmente, cela veut dire que la plupart des gens testés sont positifs, mais surtout que les personnes contaminées qui ne sont pas testées, qui passent entre les mailles du filet, sont encore plus nombreuses.

S’ils ne sont pas parfaits, ces deux indicateurs cumulés offrent donc déjà une bonne idée de la situation dans un département donné.

Nous avons également mis au point une seconde carte, visible en cliquant sur

le bouton “tendances”. Celle-ci permet non pas de visualiser les seuils de ces indicateurs, mais leur évolution dans le temps. Car ce qui est important, dans une épidémie, c’est la tendance de la courbe: si elle est à la hausse, le risque, c’est que celle-ci soit exponentielle, qu’elle monte de plus en plus vite. À l’inverse, si le taux d’incidence ou de positivité est haut, mais que les clusters sont bien contrôlés, ces indicateurs vont baisser.

Cette deuxième version de la carte vérifie donc l’évolution moyenne sur les 7 derniers jours de ces deux indicateurs pour avoir une idée des départements où l’épidémie semble progresser ou régresser.

Source : HuffPost 14/08/2020

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